话说有一年，整个福建都发生了大瘟疫，林默娘的母亲王氏在这场瘟疫中死去。

林默来听说在湄洲岛的南面有个无人居住的荒岛，这个荒岛有很多毒蛇猛兽和妖怪，所以人们称呼为魔岛。

而在这个魔岛上，有一座山洞，据说这个山洞是太上老君的葫芦所化，山洞里有千年的钟乳石水，这个这个水能治疗这个瘟疫。

魔岛由嘉应、嘉佑两兄弟的养的两个大蛇精看管着。

林默娘元神出窍飞到魔岛，与两个大蛇怪斗起来，用银镯子法器敲击两个大蛇精，然后用铜符把两个大蟒蛇打得脑浆迸裂。

林默娘除掉这两个蛇妖，然后入了魔岛的山洞里，用施法的瓶子把治疗瘟疫的圣水装了进去，然后飞到天空，施法把圣水融入天空的云层里，然后施法下雨，解除了这场瘟疫灾难。

林默娘已过及笄之年，父亲想着让她嫁人，但是她立志终身不嫁，决定一心向善，奉献一生于救助海上的生命。

林默娘二十一岁那年，莆田遇上了百年未见的大旱。当地河流干涸了，树木大多枯萎，田里的禾苗都枯焦了，黎民百姓叫苦连天。

城内的父老乡亲纷纷到县衙，请求县尹大人方市琪亲自前往湄洲，求林默娘设坛祈雨。

这个县尹方市琪，平素就贪婪歹毒，百姓对其怨声载道。

方市琪本来就不愿意降低自己身份去请求一个渔家女，但是怕旱情严重，若是百姓因此陷于绝境，发生了变乱，或者因此上告朝廷，朝廷怪罪下来，自己的官职就不保了。县尹大人方市琪迫于无奈，只好带上了几个跟班，冒着酷暑的天气，来到了湄洲。

县尹方市琪见过林默娘，说明了自己的来意，求她尽力施法，祈雨解除干旱。

林默娘问县尹方市琪，说道：“请问大人，你可知道这大旱之灾缘何而来？”

县尹方市琪答道：“自然是上天作孽。”

林默娘说道：“天道无情，不偏不私，若无因果，何来如此？”

林默娘又问道：“大人既然说是上天所为，为什么不扪心自问一下，自己做过了什么？自己不应该自责反省吗？”

县尹方市琪听见林默娘这番话，心虚得很，顿时涨红了脸，却还是喙硬狡辩道：“这………这与本官有甚干系？”

林默娘徐徐说道：“恕小女子言重了。县尹大人任职期间，积案如山，赋税加倍，奸人舞弊，百姓水深火热，当地生灵涂炭，早已激怒上苍。因此，天以旱象示儆吾郡，告诫于你。你身为父母官，敢说无甚干系吗？”